|
|
Fluorescenční zobrazovací techniky v multimodálním holografickém mikroskopu
Vašíček, David ; Procházková, Jana (oponent) ; Čolláková, Jana (vedoucí práce)
Tato diplomová práce se zabývá registrací obrazů snímků pořízených multimodálním holografickým mikroskopem (MHM). Rešerše je věnována fluorescenční a holografické mikroskopii a multimodálnímu holografickému mikroskopu, který oba tyto typy mikroskopie kombinuje. Aby bylo možné získat novou informaci kombinací obou typů snímků, je nutné každou dvojici snímků sesadit. Je popsán algoritmus pro registraci obrazů metodou fázové korelace a procedura vytvořená v prostředí MATLAB na základě tohoto algoritmu. Je popsán vliv nejdůležitějších parametrů procedury na úspěšnost registrace a jsou komentovány výsledky.
|
|
|
Sledování buněk v obrazech z holografického mikroskopu
Vičar, Tomáš ; Odstrčilík, Jan (oponent) ; Kolář, Radim (vedoucí práce)
Tato práce se věnuje sledování buněk v obrazových sekvencích pořízených pomocí multimodálního holografického mikroskopu (MHM). Princip holografického mikroskopu je zde popsán společně s jeho aplikací pro záznam buněk. Hlavní část práce popisuje společný přístup pro segmentaci a sledování jednotlivých buněk v dlouhodobých záznamech. Navržený přístup je založen na modelu parametrických aktivních kontur se specifickými modifikacemi pro dosažení přiměřené přesnosti a robustnosti. Implementovaná metoda je zde detailně popsána včetně vyhodnocení a ukázky výsledků.
|
|
|
Pozorování vlivu vnějšího prostředí na živé buňky holografickým mikroskopem
Kovářová, Klára ; Tolde,, Ondřej (oponent) ; Křížová, Aneta (vedoucí práce)
Předmětem diplomové práce je pozorování vnějšího vlivu na buňky za použití multimodálního holografického mikroskopu. Teoretická část práce pojednává nejdříve o vývoji holografické mikroskopie na ÚFI FSI VUT v Brně. Dále se práce zaměřuje na multimodální holografický mikroskop, který umožňuje neinvazivně pozorovat živé buňky. V diplomové práci je také uveden jeho popis, postup práce a zpracování hologramu. Stěžejní částí je i rešerše na téma chemotaxe buněk a osmotické jevy v buňkách. V rámci práce byly na tato témata navrženy příslušné experimenty. V experimentální části je nejdříve popsána kultivace buněk, poté příprava vzorku a komůrek pro pozorování a následně zpracování dat. Druhá polovina experimentální části je zaměřena přímo na provedená měření. Ve všech experimentech byly pozorovány buňky K2 (plné označení LW13K2).
|
|
|
Cell Tracking in Multimodal Holographic Microscope Using Transmission Mode
Blašťáková, Lucia ; Křížová, Aneta (oponent) ; Štrbková, Lenka (vedoucí práce)
This thesis is focused on the monitoring of cell dynamics in multimodal holographic microscope using transmission mode. The goal of this experiment is a quantitative description of the epithelial-mesenchymal transition of cancer cells NMuMG. The introduction briefly describes a history of interference microscopy and its applications, design of multimodal holographic microscope Q-Phase and work with the program used for data processing. Next follows a brief description of parameters that were selected to quantify the epithelial-mesenchymal transition. In conclusion, all results from the observation of epithelial-mesenchymal transition were summarized.
|
|
|
Sledování vlivu tenkých vrstev na buněčné chování v multimodálním holografickém mikroskopu
Vengh, Martin ; Křížová, Aneta (oponent) ; Štrbková, Lenka (vedoucí práce)
Úpravy povrchov materiálov pre kontakt so živými tkanivami a napodobenie prirodzeného prostredia bunky je stále viac predmetom záujmu pre ich potencionálne využitie v tkanivovom inžinierstve. Jedna z možností modifikovať povrch materiálu je vystavenie materiálu účinkom plazmy elektrického výboja v parách cyklopropylaminu. V tomto type plazmy dochádza k nízkotlakovej plazmovej polymerizácii, ktorá vytvorí tenkú povrchovú vrstvu obsahujúcu aminové skupiny. Ako sledovacia technika bol použitý multimodálny holografický mikroskop MHM Q-Phase pre určenie biokompatibility takýchto materiálov. Ten umožňuje pozorovanie v kvantitatívnom fázovom zobrazení, kde je fáza priamo úmerná suchej hmote bunky. Z toho vychádza možnosť určenia rôznych parametrov buniek, ktoré sa stávajú parametrami určujúcimi biokompatibilitu materiálov. Na základe výsledkov, tenké vrstvy bohaté na aminové skupiny zlepšili podmienky pre adhéziu a proliferáciu buniek.
|
|
|
Cell Tracking in Multimodal Holographic Microscope Using Transmission Mode
Blašťáková, Lucia ; Křížová, Aneta (oponent) ; Štrbková, Lenka (vedoucí práce)
This thesis is focused on the monitoring of cell dynamics in multimodal holographic microscope using transmission mode. The goal of this experiment is a quantitative description of the epithelial-mesenchymal transition of cancer cells NMuMG. The introduction briefly describes a history of interference microscopy and its applications, design of multimodal holographic microscope Q-Phase and work with the program used for data processing. Next follows a brief description of parameters that were selected to quantify the epithelial-mesenchymal transition. In conclusion, all results from the observation of epithelial-mesenchymal transition were summarized.
|
|
|
Sledování vlivu tenkých vrstev na buněčné chování v multimodálním holografickém mikroskopu
Vengh, Martin ; Křížová, Aneta (oponent) ; Štrbková, Lenka (vedoucí práce)
Úpravy povrchov materiálov pre kontakt so živými tkanivami a napodobenie prirodzeného prostredia bunky je stále viac predmetom záujmu pre ich potencionálne využitie v tkanivovom inžinierstve. Jedna z možností modifikovať povrch materiálu je vystavenie materiálu účinkom plazmy elektrického výboja v parách cyklopropylaminu. V tomto type plazmy dochádza k nízkotlakovej plazmovej polymerizácii, ktorá vytvorí tenkú povrchovú vrstvu obsahujúcu aminové skupiny. Ako sledovacia technika bol použitý multimodálny holografický mikroskop MHM Q-Phase pre určenie biokompatibility takýchto materiálov. Ten umožňuje pozorovanie v kvantitatívnom fázovom zobrazení, kde je fáza priamo úmerná suchej hmote bunky. Z toho vychádza možnosť určenia rôznych parametrov buniek, ktoré sa stávajú parametrami určujúcimi biokompatibilitu materiálov. Na základe výsledkov, tenké vrstvy bohaté na aminové skupiny zlepšili podmienky pre adhéziu a proliferáciu buniek.
|
|
|
Sledování buněk v obrazech z holografického mikroskopu
Vičar, Tomáš ; Odstrčilík, Jan (oponent) ; Kolář, Radim (vedoucí práce)
Tato práce se věnuje sledování buněk v obrazových sekvencích pořízených pomocí multimodálního holografického mikroskopu (MHM). Princip holografického mikroskopu je zde popsán společně s jeho aplikací pro záznam buněk. Hlavní část práce popisuje společný přístup pro segmentaci a sledování jednotlivých buněk v dlouhodobých záznamech. Navržený přístup je založen na modelu parametrických aktivních kontur se specifickými modifikacemi pro dosažení přiměřené přesnosti a robustnosti. Implementovaná metoda je zde detailně popsána včetně vyhodnocení a ukázky výsledků.
|
|
|
Pozorování vlivu vnějšího prostředí na živé buňky holografickým mikroskopem
Kovářová, Klára ; Tolde,, Ondřej (oponent) ; Křížová, Aneta (vedoucí práce)
Předmětem diplomové práce je pozorování vnějšího vlivu na buňky za použití multimodálního holografického mikroskopu. Teoretická část práce pojednává nejdříve o vývoji holografické mikroskopie na ÚFI FSI VUT v Brně. Dále se práce zaměřuje na multimodální holografický mikroskop, který umožňuje neinvazivně pozorovat živé buňky. V diplomové práci je také uveden jeho popis, postup práce a zpracování hologramu. Stěžejní částí je i rešerše na téma chemotaxe buněk a osmotické jevy v buňkách. V rámci práce byly na tato témata navrženy příslušné experimenty. V experimentální části je nejdříve popsána kultivace buněk, poté příprava vzorku a komůrek pro pozorování a následně zpracování dat. Druhá polovina experimentální části je zaměřena přímo na provedená měření. Ve všech experimentech byly pozorovány buňky K2 (plné označení LW13K2).
|
|
|
Fluorescenční zobrazovací techniky v multimodálním holografickém mikroskopu
Vašíček, David ; Procházková, Jana (oponent) ; Čolláková, Jana (vedoucí práce)
Tato diplomová práce se zabývá registrací obrazů snímků pořízených multimodálním holografickým mikroskopem (MHM). Rešerše je věnována fluorescenční a holografické mikroskopii a multimodálnímu holografickému mikroskopu, který oba tyto typy mikroskopie kombinuje. Aby bylo možné získat novou informaci kombinací obou typů snímků, je nutné každou dvojici snímků sesadit. Je popsán algoritmus pro registraci obrazů metodou fázové korelace a procedura vytvořená v prostředí MATLAB na základě tohoto algoritmu. Je popsán vliv nejdůležitějších parametrů procedury na úspěšnost registrace a jsou komentovány výsledky.
|
host ::
RSS.